哈尔滨大学城区域内共有23所高等院校，包括16所本科院校和7所专科院校。其中，哈尔滨工业大学是哈尔滨市唯一一所211工程重点建设大学、985工程优势学科创新平台、国家“双一流”高水平建设高校。哈尔滨工程大学是我国有船舶、海洋和核工程学科三个一流学科的大学，是国家“211工程”和“985工程优势学科创新平台”重点建设高校。除此之外，黑龙江大学、东北农业大学、黑龙江中医药大学等高等院校在本区域内也具有一定的优势和特色，拥有一流的教育设施和师资力量，为学生提供了良好的学习和成长环境。