河豚鱼除了味道特别鲜美之外，还有很多鲜为人知的营养价值和保健作用。它富含蛋白质、维生素、氨基酸、不饱和脂肪酸、微量元素等，尤其是可食部位中的谷氨酸含量为鱼类之最。

研究表明：河豚鱼除富含蛋白质外(养殖17.71％、野生18.75比一般鱼类高出2~3%)；还含17种氨基酸和牛磺酸(参见表一)、鱼精蛋白、胶原蛋白；又富含微量元素硒、锌等，其肌肉中硒的含量41.25微克/100克是团鱼硒含量15.19微克/100克的2.7倍、锌含量3.65毫克/100克，是团鱼锌含量2.31毫克/100克的1.58倍。至于河豚鱼皮的蛋白质含量和硒、锌含量更高，其蛋白质含量23.7%比一般鱼类高出约5%左釉冬硒含量63.78微克/克、锌含量12.15毫克/100克分别是团鱼中硒、锌含量的4.2倍和5.28倍。其不饱和脂肪酸含量超过20％，其中DHA（脑白金）占15.36%，EPA(脑黄金)为6.19％；碳水化合物0.26克、总热量95.70kcal（1 cal＝4.18）；维生素A104单位、维生素B1110微克、维生素B2100微克、维生素B32.5毫克，谷氨酸含量是鱼中之最。脂肪含量仅为0.26克。

近年来被科学研究证实，鱼精蛋白、胶原蛋白、牛磺酸、硒、锌、等微量元素和EPA、DHA等都具很高的营养价值和保健功能，若依此往和人们以为营养价值较高的团鱼等食品作比较，那么河豚鱼的营养价值和保健功能就不问可知了。